NACIONES UNIDAS
El CETMO está vinculado a la ONU desde sus orígenes. Se creó el 1985 como resultado de la Conferencia de Tesalónica celebrada por la Comisión Económica de la ONU para Europa (UNECE) en cooperación con las Comisiones Regionales de la ONU de África (UNECA) y Asia Occidental (ESCWA) para abordar los problemas específicos de transporte en el Mediterráneo. Desde entonces, el CETMO es una organización asociada a la ONU con estatus de Observador Permanente.
Estos estrechos vínculos proporcionan un mayor conocimiento de las tendencias, propuestas políticas y problemas globales, así como acceso al marco de cooperación internacional e iniciativas de la ONU. Desde su creación, el CETMO ha participado activamente en el Comité de Transporte Interior (ICT), y en el Grupo de Trabajo sobre Tendencias y Economía del Transporte (WP5).
UNIÓN EUROPEA
En 1995 la UE estableció una Política de Vecindad global, que incluye programas de cooperación específicos para el Norte de África y el Mediterráneo Oriental. Todas las iniciativas de cooperación multilateral en el sector del transporte, se integraron en 2005 en el Foro de Transporte EuroMed (FET), en el que el CETMO ha desempeñado un papel de liderazgo en la definición de la agenda de actuaciones.
El CETMO proporcionó el análisis, el marco y las directrices técnicas para los dos primeros grandes programas emprendidos por el FET: El programa REG-MED (mejora del marco regulatorio) y DESTIN (definición y evaluación de la red estratégica de infraestructura de transporte en el Mediterráneo Occidental). También coordinó un consorcio Euro-Magrebí para analizar y mejorar la interoperabilidad del transporte y su compatibilidad con la Red Trans-europea de Transporte (TEN-T) de la UE.
UNIÓN POR EL MEDITERRÁNEO (UpM)
Con el objetivo de incrementar la cooperación mediterránea, en 2008 se fundó la UpM como un foro ampliado que engloba a la UE, los países del Norte de África, y del Mediterráneo Oriental, así como los Balcanes.
El CETMO ha estado implicado desde la gestación de la UpM: definió y promovió con éxito el Corredor Multimodal Trans-Magrebí, el programa Autopistas del Mar (UpM-Mos), y ejecutó el programa de modernización de la logística regional, LOGISMED, financiado por el Banco Europeo de Inversiones. El CETMO hoy mantiene una colaboración permanente con la UpM, abogando por políticas específicas de transporte, y ejecutando y coordinando proyectos regionales de transporte y logística.